Los templarios lucharon contra el Islam durante casi dos siglos. En ese tiempo, la pequeña banda original se convirtió en un formidable ejército, respaldado por una extensa red de encomiendas en el Occidente latino.
En octubre de 1307, los miembros de esta orden aparentemente invulnerable y respetados fueron arrestados por orden de Felipe IV, rey de Francia, y acusados de herejías graves, como la negación de Cristo, la homosexualidad y la idolatría. Dichas acciones se prolongó durante casi cinco años, y culminó en la supresión de la Orden. Las motivaciones de los participantes y sus repercusiones han sido objeto de intensa controversia y que no han resueltos, teniendo resonancias aún en nuestro propio tiempo. Lo que sí está claro es la intervención del papado y la monarquía francesa en el juicio a los templarios.
Los templarios eran una orden religiosa militar, fundada en Tierra Santa en 1119. Durante los siglos XII y XIII adquirieron extensas propiedades tanto en los estados de Palestina y Siria, y en Occidente, especialmente en Francia, y se les concedió gran alcance privilegios eclesiásticos y jurisdiccionales, tanto por los papas, y por los monarcas seculares en cuyas tierras residían sus miembros. También fueron banqueros a gran escala, una posición facilitada por el carácter internacional de su organización. Pero sobre todo les dieron una gran parte de la responsabilidad en la defensa militar de los estados en el Este, y habían llegado a ser famosos y poderosos. Sin embargo, en 1291, los pobladores cristianos de Oriente fueron expulsados de Palestina por los mamelucos de Egipto, y los Templarios dejaron de lado el objetivo principal de su existencia. De pronto, en la madrugada del viernes 13 octubre 1307, los hermanos de la Orden residentes en Francia fueron arrestados por los oficiales del rey Felipe IV, en nombre de los inquisidores papales, y sus propiedades fueron ocupadas por los representantes reales.
Fueron acusados de herejías graves que abarca desde la negación de Cristo y escupir el crucifijo, besos y la homosexualidad indecente, y adoración de ídolo, llevadas a cabo en las recepciones y reuniones secretas de la Orden.
En octubre y noviembre, los Templarios capturados, entre ellos Jaime de Molay, el gran maestro, y Hugo de Pairaud (visitador de Francia), confesó casi unánimemente su culpabilidad. La tortura se utiliza libremente en muchos de los prisioneros. Molay repitió su confesión ante una asamblea pública de los teólogos de la universidad de París. Por su parte el rey Felipe escribió a los otros monarcas de la cristiandad instándolos a seguir su ejemplo para detener a los templarios en sus propias tierras, por las confesiones que habían demostrado ser herejes manifiestos.
El Papa reinante, Clemente V, en un primer momento vio las detenciones como una afrenta directa a su autoridad, debido a que los templarios eran de confianza ante el papado, y aunque el verano anterior había habido conversaciones entre el papa y el rey sobre el estado de la Orden , Clemente no había autorizado las detenciones. Sin embargo, después de su enojo inicial, se vio obligado a aceptar la situación y, en lugar de resistir, se esforzó por ponerse al mando. El 22 de noviembre 1307 se emitió la bula Pastoralis praeeminentiae, que ordenó a todos los monarcas de la cristiandad a detener a los templarios y confiscar sus tierras en nombre del papado.
Esta bula papal inició procedimientos en las Islas Británicas, Iberia, Alemania, Italia y Chipre. Dos cardenales fueron enviados a París para entrevistarse con los líderes de la Orden personalmente. Pero, una vez frente a los representantes papales, Molay y Pairaud revocaron sus confesiones e instó al resto de los templarios a hacer lo mismo. Por ahora el Papa había llegado a ser altamente sospechoso de todo el asunto y, a principios de 1308, se suspendieron los procedimientos inquisitoriales. Felipe IV y sus ministros se vieron obligados a pasar los próximos seis meses en un intento de obligar al Papa a reabrir el juicio, tanto por el cálculo de referencias de la opinión pública y teológicos en Francia, y por la amenaza implícita de violencia física contra el mismo Papa. Esta campaña culminó en una reunión entre el Papa y el rey en Poitiers, en mayo y junio de 1308, en la que, después de mucho debate, el Papa finalmente acordó la creación de dos tipos de investigación: uno por una comisión papal en la propia Orden, y otro que consiste en una serie de consejos provinciales, celebradas a nivel diocesano, para investigar la culpabilidad o inocencia de los Templarios.
Por otra parte, un concilio general de la Iglesia fue organizada, que se celebrará en Viena en octubre de 1310, para tomar una decisión definitiva sobre el asunto. Mientras tanto, tres cardenales fueron enviados a Chinon para escuchar las declaraciones de los líderes de la Orden que fueron encarcelados allí, sólo para descubrir que habían vuelto a sus confesiones originales.
Las investigaciones episcopales, que fueron dominados en gran medida por los obispos estrechamente asociados a la monarquía francesa, parecen haber comenzado a trabajar en 1309, y parece que en la mayoría de los casos, los templarios repitieron sus confesiones, una vez más bajo la presión de una amplia tortura. La comisión papal investigó la Orden en su conjunto y no comenzó sus sesiones hasta noviembre de 1309. Al principio parecía que el patrón familiar de confesiones se mantenía, pero al principio vacilante y luego con creciente ímpetu, los hermanos, encabezados por dos sacerdotes templarios capaces, Pedro de Bolonia y Reginaldo de Provins, comenzó a montar una defensa de su Orden y su estilo de vida antes de la comisión.
A principios de mayo 1310 casi seiscientos templarios habían acordado defender a la Orden, negando la validez de las confesiones anteriores ya lo hicieron ante los inquisidores en 1307 y a los obispos en 1309. El papa Clemente, al ver que no cedían de inmediato, pospuso el concilio de Vienne durante un año hasta octubre de 1311.
Para aplastar esta cada vez más decidido la defensa de los templarios, Felipe IV tomó medidas drásticas. El arzobispo de Sens, un candidato real, reabrió su investigación contra Templarios dentro de la provincia y, la búsqueda de cincuenta y cuatro de ellos culpables de ser herejes, los entregó a las autoridades seculares.
El 12 de mayo 1310 cincuenta y cuatro templarios fueron quemados en la hoguera en un campo de las afueras de París. De los dos principales defensores, Pedro de Bolonia desapareció misteriosamente, y Reginaldo de Provins fue condenado a cadena perpetua por el consejo de los senadores con la excepción de unos pocos valientes, las hogueras silenciaba efectivamente la defensa, y muchos templarios volvieron a sus confesiones originales. Las audiencias de la comisión papal finalmente extinguieron en junio de 1311.
En el verano de 1311 el Papa había recopilado la evidencia enviada desde Francia, así como el material que poco a poco llegó a partir de los otros países en los que se habían llevado a cabo los procedimientos. En esencia, sólo en Francia y en las regiones bajo el dominio o influencia francesa estaban allí las confesiones importantes de templarios.
En octubre, el Consejo de Vienne, al fin abrió, y el Papa presionó por la supresión (aunque no la condena) de la Orden sobre la base de que ya era demasiado la difamación y a seguir adelante. Sin embargo, la resistencia entre los que lideran el consejo era considerable, y el Papa, presionado por la presencia militar del rey de Francia, sólo logró su voluntad por imponer el silencio en el consejo para ser interrumpido bajo pena de excomunión.
La bula Vox in excelso de 22 de marzo 1312 suprimió la Orden, y Ad providam de 02 de mayo otorgó su propiedad a la otra gran orden militar del Hospital. Poco después, Felipe IV extrae una gran suma de dinero de los hospitalarios en una compensación por sus gastos en traer a los templarios a juicio.
En cuanto a los templarios particulares, en algunos casos tuvieron que someterse a penitencias pesadas incluyendo prisión perpetua, y en otros, donde no habían admitido su culpabilidad, fueron enviados a los monasterios de otras órdenes para quedarse el resto de sus vidas en ese lugar. Los líderes finalmente se presentaron ante los representantes pontificios en 18 de marzo 1314 y fueron condenados a cadena perpetua.
Hugo de Pairaud y Godofredo de Gonneville, preceptor de Aquitania, acepta su destino en silencio, pero Jaime de Molay y Godofredo de Charney, preceptor de Normandía, en voz alta protestó su inocencia y afirmó que la Orden era puro y santo. De inmediato el rey ordenó que fueran condenados como herejes y, en la misma noche, fueron quemados en la hoguera en la Ile des Javiaux en el Sena.